Bilim insanları, DNA sentezi siparişlerindeki potansiyel biyolojik tehditleri tespit etmek için yeni bir güvenlik sistemi geliştirdi. CRC-Screen adlı bu sistem, mevcut güvenlik protokollerinin büyük bir açığını kapatıyor. Geleneksel yöntemler, bilinen tehlikeli DNA dizilerini referans listelerle karşılaştırarak çalışır, ancak bu yaklaşım yeni veya bilinmeyen toksik organizmaların DNA dizileri karşısında yetersiz kalıyor. Araştırmacılar, yapay zeka destekli üç farklı analiz yöntemini birleştiren hibrit bir sistem tasarladı. Bu sistem, DNA dizilerinin k-mer benzerliklerini, beş farklı büyük dil modelinin değerlendirmelerini ve kümelenmiş veri yapılarındaki kosinüs benzerliklerini analiz ediyor. Test sonuçları, sistemin farklı taksonomik ailelerden gelen tehlikeli DNA dizilerini %100 başarıyla tespit ettiğini gösteriyor. Bu gelişme, biyogüvenlik alanında önemli bir adım olarak değerlendiriliyor.

arXiv (Biyoloji) 0

Biyoloji & Yaşam Bilimleri

16 Apr

Yapay zeka ile bağışıklık sistemi tahmini: Güvenilir T hücresi araştırması

Araştırmacılar, T hücresi reseptörlerinin peptid-MHC molekül bağlanmalarını tahmin etmek için yeni bir yapay zeka modeli geliştirdi. Bu sistem, aşı tasarımı ve T hücresi tedavilerinde kritik öneme sahip. Yeni yaklaşım, modelin eğitim sırasında görmediği epitoplarla karşılaştığında sessizce yanlış güven skoru vermesi sorununu çözmeyi hedefliyor. Araştırmacılar, güvenilir tahminler yapabilmek için 'seçici tahmin' yaklaşımını benimsiyor - model ya güvenilir bir skor verir ya da açıkça karar vermekten kaçınır. Dual-encoder mimarisi kullanan sistem, protein dil modeliyle eğitilmiş ve sıcaklık ölçeklendirmesi ile kalibre edilmiş. Conformal abstention kuralı sayesinde kullanıcının belirlediği hata oranında finite-sample kapsama garantisi sağlıyor. Üç farklı test stratejisinde değerlendirilen method, AUROC 0.813 ve ECE 0.043 değerlerine ulaştı.

arXiv (CS + AI) 0